Управление КГАОУ ДПО ХК ИРО осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации и Уставом на основе сочетания принципов единоначалия и коллегиальности.

В КГАОУ ДПО ХК ИРО созданы и функционируют следующие коллегиальные органы государственно-общественного управления: Ученый совет, общее собрание работников КГАОУ ДПО ХК ИРО, наблюдательный совет, совет трудового коллектива, выборный профсоюзный орган.

Деятельность советов носит государственно-общественный характер и позволяет учитывать общественное мнение при планировании и реализации образовательной и финансово-хозяйственной деятельности КГАОУ ДПО ХК ИРО.

Общее руководство деятельностью КГАОУ ДПО ХК ИРО осуществляет выборный представительный орган – Ученый совет. Срок полномочий его состава составляет пять лет. В состав совета входят 23 человека: ректор, который является его председателем, проректоры, директора центров, начальники отделов, заведующие кафедрами и представитель министерства образования и науки края. Полномочия Ученого совета определены уставом Института и Положением об Ученом совете. Заседания Ученого совета проводятся ежемесячно по утвержденному годовому плану работы.

Согласно распоряжению Правительства Хабаровского края от 24 сентября 2020 г. №1017-рп «О создании краевого государственного автономного образовательного учреждения дополнительного профессионального образования «Хабаровский краевой институт развития образования» с 12 ноября 2020 г. КГАОУ ДПО ХК ИРО изменил тип учреждения с бюджетного на автономное.

Распоряжением Правительства Хабаровского края от 11.10.2023 г. № 670-рп «О присвоении краевому государственному автономному образовательному учреждению дополнительного профессионального образования «Хабаровский краевой институт развития образования» имени К.Д. Ушинского, учреждение переименовано в краевое государственное автономное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования «Хабаровский краевой институт развития образования имени К.Д. Ушинского».

Проректоры по основным направлениям деятельности КГАОУ ДПО ХК ИРО координируют работу по реализации и развитию концепции КГАОУ ДПО ХК ИРО, задач, предусмотренных Уставом, выполнению количественных и качественных показателей государственного задания и руководят деятельностью следующих структурных подразделений:

- центры: Центр проектно-аналитической, информационной работы и развития программ сотрудничества, Центр хозяйственной и информационно-технической работы, Центр профессионального самоопределения и наставничества, Центр непрерывного повышения профессионального мастерства педагогических работников и управленческих кадров, Центр воспитания и социализации, Центр учебно-методической работы, Центр развития научно-исследовательской и инновационной работы в образовании, Центр редакционно-издательской работы, Центр цифровой трансформации и развития образования в сфере креативных индустрий, Центр содержания и оценки качества образования, Центр развития профильного обучения, дополнительного образования и олимпиадного движения, Центр содержания и оценки качества среднего профессионального образования, Центр коррекционного и инклюзивного образования, Центр развития профессиональных сообществ и конкурсного движения.

- отделы, не входящие в структуру центров: Отдел аналитико-мониторинговой деятельности и музейного дела, Отдел бухгалтерского учета и отчетности, Отдел финансово-экономической работы и государственного задания, Отдел правовой работы и организации государственных закупок, Отдел кадрового администрирования и развития персонала, Отдел документационного обеспечения и архива, Отдел эксплуатационной и транспортной работы, Отдел хозяйственной работы, Отдел информационно-технической работы.

- кафедры: педагогики и психологии, теории и методики обучения, менеджмента в образовании.

Все сотрудники КГАОУ ДПО ХК ИРО работают в условиях эффективного контракта по показателям, позволяющим оценить результативность их деятельности и качество выполняемых должностных обязанностей.